Είναι ένα απλό υπερηχογράφημα που γίνεται περί την 22η εβδομάδα της εγκυμοσύνης στο οποίο εκτός από τον συνήθη έλεγχο του εμβρύου και τις μετρήσεις ανάπτυξης γίνεται επιπλέον εκτενής και αναλυτικός έλεγχος της ανατομίας του. Επίσης εκτιμώνται και κάποιες άλλες παράμετροι, όπως για παράδειγμα η σχέση μήκους των μακρών οστών εμβρύου, το πάχος της αυχενικής πτυχής (nuchal fold), η σχέση μεγεθών κεφαλής και μηριαίου οστού, κά. Στη συνέχεια με τη βοήθεια ενός Doppler και με δεδομένα τις φυσιολογικές καμπύλες ανάπτυξης και τις σχέσεις των μετρήσεων, υπολογίζονται οι βιομετρικοί δείκτες του εμβρύου και η στατιστική πιθανότητα να πάσχει από χρωμοσωμική ανωμαλία που προκαλεί νοητική καθυστέρηση (Σύνδρομο Down, Turner κλπ).

Επί πλέον ελέγχεται το έμβρυο αν έχει κάποια συγγενή ανωμαλία, δηλαδή ανωμαλία διάπλασης που δεν έχει σχέση με χρωμοσώματα η οποία να είναι μακροσκοπικά ορατή με την συσκευή των υπερήχων, όπως για παράδειγμα το κυστικό ύγρωμα, η εγκεφαλοκήλη, το ανεγκέφαλο κλπ. Η διαπίστωση κάποιας συγγενούς ανωμαλίας εκτός το ότι εκτιμάται αν είναι συμβατή με τη ζωή του εμβρύου ή αν είναι ανατάξιμη, αν δηλαδή διορθώνεται, είναι και ένας δείκτης για την πιθανότητα ύπαρξης χρωμοσωμικής ανωμαλίας. Αυτά αποτελούν τους ανατομικούς δείκτες.

Σαφής προϋπόθεση για τη σωστή εκτίμηση είναι ο εξεταστής να είναι έμπειρος και να έχει κάνει την μετεκπαίδευση που προβλέπεται.